Формирование системы управления качеством ВятГУ осуществляется на основе международных стандартов качества ISOсерии 9000 с учетом требований стандартов и директив ENQA, документов Типовой модели системы качества образовательного учреждения.
Университет был участником учебно-методического инновационного проекта «Апробация и внедрение типовой модели системы качества учреждения профессионального образования». По результатам представленного отчета получен сертификат участника проекта (серия В2-07 № 20), декабрь 2007 г., Москва, Совет по координации управления качеством профессионального образования Рособрнадзора. В 2010 г. университет принял участие в конкурсе Рособрнадзора «Системы качества подготовки выпускников образовательных учреждений профессионального образования».